Untuk penyakit yang disebabkan oleh infeksi virus, untuk memperjelas jenis virus yang akan diobati, dapat dilakukan dua jenis pemeriksaan berikut:
1. Deteksi langsung virus itu sendiri
2. Dapat mendeteksi antigen pada permukaan virus dan asam nukleat virus.
Tes tersebut mengidentifikasi antibodi yang diproduksi untuk melawan virus:
Dalam keadaan normal, pengujian antigen tidak memerlukan kondisi laboratorium yang tinggi, dan terutama cocok untuk skrining skala besar di rumah sakit primer; pengujian antibodi mudah dioperasikan, dan hasil pengujian dapat diperoleh dalam 10-15 menit. Deteksi asam nukleat membutuhkan banyak kondisi laboratorium, personel intermiten, dan peralatan, tetapi halaman hasil adalah yang paling sensitif dan akurat.
Dari 10 reagen pendeteksi asam nukleat virus corona baru yang telah disetujui, 8 diantaranya menggunakan metode fluorescent PCR, dan metode deteksi sisanya adalah metode gabungan probe-anchored polymerization sequencing dan metode constant temperature amplification chip.
1. Metode PCR Fluoresensi
Metode PCR mengacu pada reaksi berantai polimerase, yang dapat sangat meningkatkan jumlah jejak DNA. Saat digunakan untuk mendeteksi virus corona baru, karena virus corona baru adalah virus RNA, maka perlu dilakukan reverse transcribe RNA virus menjadi DNA sebelum melakukan deteksi PCR.
Prinsip deteksi PCR fluoresen adalah bahwa saat PCR berlangsung, produk reaksi terus menumpuk, dan intensitas sinyal fluoresensi juga meningkat secara proporsional. Akhirnya, perubahan jumlah produk dipantau oleh perubahan intensitas fluoresensi, sehingga diperoleh kurva amplifikasi fluoresensi.
Saat ini metode yang paling umum digunakan untuk deteksi asam nukleat dari virus corona baru. Namun, faktor-faktor berikut dapat menyebabkan kesalahan dalam hasil pengujian:
Penyimpanan yang tidak tepat atau kegagalan pengiriman untuk pengujian: Virus RNA mudah terdegradasi. Oleh karena itu, setelah mendapatkan sampel pasien, mereka perlu disimpan dengan cara yang terstandarisasi dan diuji sesegera mungkin. Jika tidak, hasil tes kemungkinan besar tidak akurat.
Penafsiran kesalahan hasil: Produk uji yang saat ini disetujui dipilih berdasarkan kerangka baca terbuka 1a/b, protein amplop, dan protein nukleokapsid dari genom virus corona baru. Namun, primer deteksi dan desain probe dari produk yang berbeda berbeda, dan ada perbedaan dalam deteksi dan interpretasi segmen target tunggal, segmen target ganda, dan segmen tiga target. Oleh karena itu, jika interpretasi tidak dilakukan secara ketat sesuai dengan instruksi yang berbeda, itu dapat menyebabkan penilaian hasil yang salah.
2. Metode pengurutan polimerisasi berlabuh probe gabungan
Deteksi ini terutama menggunakan instrumen khusus untuk mendeteksi urutan gen yang dibawa oleh nanosfer DNA pada slide sekuensing.
Deteksi semacam ini memiliki sensitivitas yang tinggi dan tidak mudah melewatkan diagnosis, namun hasilnya juga mudah dipengaruhi oleh banyak faktor, antara lain:
Sampel tidak diuji tepat waktu: Seperti metode PCR fluoresen, hasilnya mungkin tidak akurat jika tidak disimpan dengan cara yang terstandarisasi dan diuji sesegera mungkin.
Suhu ruangan tempat pengujian terlalu tinggi: Ini juga akan mempengaruhi keakuratan hasil pengujian. Instrumen dan kit pengujian yang berbeda juga dapat memengaruhi hasil.
3. Metode chip amplifikasi suhu konstan
Deteksi chip gen adalah salah satu metode diagnostik virologi tradisional. Prinsip deteksi adalah metode deteksi yang dikembangkan berdasarkan karakteristik pengikatan komplementer asam nukleat, yang dapat digunakan untuk mengukur secara kualitatif atau kuantitatif asam nukleat yang ada dalam organisme. Dibandingkan dengan PCR, chip gen memiliki tingkat akurasi yang lebih tinggi dan waktu yang lebih singkat, tetapi juga lebih mahal dan throughput deteksi (jumlah data yang dapat dihasilkan per satuan waktu) relatif lebih rendah.
Chip termostat yang disetujui kali ini dapat mendeteksi enam jenis virus pernapasan, termasuk virus corona baru. Hasil dapat diperoleh dalam waktu 1,5 jam,
Dibandingkan dengan PCR, chip gen memiliki tingkat akurasi yang lebih tinggi dan waktu yang lebih singkat, tetapi harganya lebih mahal, dan throughput deteksi (jumlah data yang dapat dihasilkan per satuan waktu) relatif lebih rendah.
4. Deteksi antibodi virus
Reagen pendeteksi antibodi digunakan untuk mendeteksi antibodi IgM atau IgG yang diproduksi oleh tubuh manusia setelah virus masuk ke dalam tubuh manusia. Antibodi IgM muncul lebih awal dan antibodi IgG muncul kemudian.
Saat ini, lima reagen pendeteksi antibodi virus corona baru yang telah disetujui menggunakan metode koloid emas dan metode chemiluminescence partikel magnetik.
5. Metode emas koloid
Metode emas koloid menggunakan kertas uji koloid emas untuk pengujian, yang merupakan kertas uji cepat yang sering disebut saat ini.
Jenis kertas tes ini diberi tanda khusus dan memiliki lubang di atasnya, yang digunakan untuk meneteskan sampel serum peserta ujian. Ada dua garis pada kertas uji koloid emas, satu disebut garis uji dan yang lainnya disebut garis kendali mutu. Jika kedua garis berwarna, itu berarti positif; hanya garis kontrol kualitas yang diwarnai, yang berarti negatif; kecuali untuk dua kasus ini, itu termasuk hasil yang tidak valid.